IEDB Analysis Resource
Home
Help
Example
Reference
Download
Contact
Your browser does not support JavaScript or JavaScript support has been disabled. You must enable JavaScript to use many of the tools on this website.
MHC-II binding predictions
Loading... please wait.
Specify Sequence(s)
Enter protein sequence(s)
(Browse for sequences in NCBI)
Or select file containing sequence(s)
Choose sequence format
auto detect format
Space separated sequences
One sequence (ignores spaces)
FASTA format
Choose a Prediction Method
Prediction Method
IEDB recommended
consensus
NetMHCIIpan
nn_align
smm_align
combinatorial library
Sturniolo
arb
Help on prediction method selections
Specify what to make binding predictions for
MHC allele(s)
Select allele
HLA DPA1*01-DPB1*0401
HLA DPA1*0103-DPB1*0201
HLA DPA1*0201-DPB1*0101
HLA DPA1*0201-DPB1*0501
HLA DPA1*0301-DPB1*0402
HLA DQA1*0101-DQB1*0501
HLA DQA1*0102-DQB1*0602
HLA DQA1*0301-DQB1*0302
HLA DQA1*0401-DQB1*0402
HLA DQA1*0501-DQB1*0201
HLA DQA1*0501-DQB1*0301
HLA DRB1*0101
HLA DRB1*0102
HLA DRB1*0103
HLA DRB1*0104
HLA DRB1*0105
HLA DRB1*0106
HLA DRB1*0107
HLA DRB1*0108
HLA DRB1*0109
HLA DRB1*0110
HLA DRB1*0111
HLA DRB1*0112
HLA DRB1*0113
HLA DRB1*0114
HLA DRB1*0115
HLA DRB1*0116
HLA DRB1*0117
HLA DRB1*0118
HLA DRB1*0119
HLA DRB1*0301
HLA DRB1*0302
HLA DRB1*0303
HLA DRB1*0304
HLA DRB1*0305
HLA DRB1*0306
HLA DRB1*0307
HLA DRB1*0308
HLA DRB1*0309
HLA DRB1*0310
HLA DRB1*0311
HLA DRB1*0312
HLA DRB1*0313
HLA DRB1*0314
HLA DRB1*0315
HLA DRB1*0316
HLA DRB1*0317
HLA DRB1*0318
HLA DRB1*0319
HLA DRB1*0320
HLA DRB1*0321
HLA DRB1*0322
HLA DRB1*0323
HLA DRB1*0324
HLA DRB1*0325
HLA DRB1*0326
HLA DRB1*0327
HLA DRB1*0328
HLA DRB1*0329
HLA DRB1*0330
HLA DRB1*0331
HLA DRB1*0332
HLA DRB1*0333
HLA DRB1*0334
HLA DRB1*0335
HLA DRB1*0336
HLA DRB1*0337
HLA DRB1*0338
HLA DRB1*0339
HLA DRB1*0401
HLA DRB1*0402
HLA DRB1*0403
HLA DRB1*0404
HLA DRB1*0405
HLA DRB1*0406
HLA DRB1*0407
HLA DRB1*0408
HLA DRB1*0409
HLA DRB1*0410
HLA DRB1*0411
HLA DRB1*0412
HLA DRB1*0413
HLA DRB1*0414
HLA DRB1*0415
HLA DRB1*0416
HLA DRB1*0417
HLA DRB1*0418
HLA DRB1*0419
HLA DRB1*0420
HLA DRB1*0421
HLA DRB1*0422
HLA DRB1*0423
HLA DRB1*0424
HLA DRB1*0425
HLA DRB1*0426
HLA DRB1*0427
HLA DRB1*0428
HLA DRB1*0429
HLA DRB1*0430
HLA DRB1*0431
HLA DRB1*0432
HLA DRB1*0433
HLA DRB1*0434
HLA DRB1*0435
HLA DRB1*0436
HLA DRB1*0437
HLA DRB1*0438
HLA DRB1*0439
HLA DRB1*0440
HLA DRB1*0441
HLA DRB1*0442
HLA DRB1*0443
HLA DRB1*0444
HLA DRB1*0445
HLA DRB1*0446
HLA DRB1*0447
HLA DRB1*0448
HLA DRB1*0449
HLA DRB1*0450
HLA DRB1*0451
HLA DRB1*0452
HLA DRB1*0453
HLA DRB1*0454
HLA DRB1*0455
HLA DRB1*0456
HLA DRB1*0457
HLA DRB1*0458
HLA DRB1*0459
HLA DRB1*0460
HLA DRB1*0461
HLA DRB1*0462
HLA DRB1*0463
HLA DRB1*0464
HLA DRB1*0465
HLA DRB1*0466
HLA DRB1*0467
HLA DRB1*0468
HLA DRB1*0469
HLA DRB1*0470
HLA DRB1*0471
HLA DRB1*0701
HLA DRB1*0703
HLA DRB1*0704
HLA DRB1*0705
HLA DRB1*0706
HLA DRB1*0707
HLA DRB1*0708
HLA DRB1*0709
HLA DRB1*0711
HLA DRB1*0712
HLA DRB1*0713
HLA DRB1*0714
HLA DRB1*0715
HLA DRB1*0801
HLA DRB1*0802
HLA DRB1*0803
HLA DRB1*0804
HLA DRB1*0805
HLA DRB1*0806
HLA DRB1*0807
HLA DRB1*0808
HLA DRB1*0809
HLA DRB1*0810
HLA DRB1*0811
HLA DRB1*0812
HLA DRB1*0813
HLA DRB1*0814
HLA DRB1*0815
HLA DRB1*0816
HLA DRB1*0817
HLA DRB1*0818
HLA DRB1*0819
HLA DRB1*0820
HLA DRB1*0821
HLA DRB1*0822
HLA DRB1*0823
HLA DRB1*0824
HLA DRB1*0825
HLA DRB1*0826
HLA DRB1*0827
HLA DRB1*0828
HLA DRB1*0829
HLA DRB1*0830
HLA DRB1*0831
HLA DRB1*0832
HLA DRB1*0833
HLA DRB1*0834
HLA DRB1*0901
HLA DRB1*0902
HLA DRB1*0903
HLA DRB1*0904
HLA DRB1*0905
HLA DRB1*0906
HLA DRB1*1001
HLA DRB1*1002
HLA DRB1*1101
HLA DRB1*1102
HLA DRB1*1103
HLA DRB1*1104
HLA DRB1*1105
HLA DRB1*1106
HLA DRB1*1107
HLA DRB1*1108
HLA DRB1*1109
HLA DRB1*1110
HLA DRB1*1111
HLA DRB1*1112
HLA DRB1*1113
HLA DRB1*1114
HLA DRB1*1115
HLA DRB1*1116
HLA DRB1*1117
HLA DRB1*1118
HLA DRB1*1119
HLA DRB1*1120
HLA DRB1*1121
HLA DRB1*1122
HLA DRB1*1123
HLA DRB1*1124
HLA DRB1*1125
HLA DRB1*1126
HLA DRB1*1127
HLA DRB1*1128
HLA DRB1*1129
HLA DRB1*1130
HLA DRB1*1131
HLA DRB1*1132
HLA DRB1*1133
HLA DRB1*1134
HLA DRB1*1135
HLA DRB1*1136
HLA DRB1*1137
HLA DRB1*1138
HLA DRB1*1139
HLA DRB1*1140
HLA DRB1*1141
HLA DRB1*1142
HLA DRB1*1143
HLA DRB1*1144
HLA DRB1*1145
HLA DRB1*1146
HLA DRB1*1147
HLA DRB1*1148
HLA DRB1*1149
HLA DRB1*1150
HLA DRB1*1151
HLA DRB1*1152
HLA DRB1*1153
HLA DRB1*1154
HLA DRB1*1155
HLA DRB1*1156
HLA DRB1*1157
HLA DRB1*1158
HLA DRB1*1159
HLA DRB1*1160
HLA DRB1*1161
HLA DRB1*1162
HLA DRB1*1163
HLA DRB1*1164
HLA DRB1*1165
HLA DRB1*1166
HLA DRB1*1201
HLA DRB1*1202
HLA DRB1*1203
HLA DRB1*1204
HLA DRB1*1205
HLA DRB1*1206
HLA DRB1*1207
HLA DRB1*1208
HLA DRB1*1209
HLA DRB1*1210
HLA DRB1*1211
HLA DRB1*1212
HLA DRB1*1213
HLA DRB1*1214
HLA DRB1*1215
HLA DRB1*1216
HLA DRB1*1301
HLA DRB1*1302
HLA DRB1*1303
HLA DRB1*1304
HLA DRB1*1305
HLA DRB1*1306
HLA DRB1*1307
HLA DRB1*1308
HLA DRB1*1309
HLA DRB1*1310
HLA DRB1*1311
HLA DRB1*1312
HLA DRB1*1313
HLA DRB1*1314
HLA DRB1*1315
HLA DRB1*1316
HLA DRB1*1317
HLA DRB1*1318
HLA DRB1*1319
HLA DRB1*1320
HLA DRB1*1321
HLA DRB1*1322
HLA DRB1*1323
HLA DRB1*1324
HLA DRB1*1325
HLA DRB1*1326
HLA DRB1*1327
HLA DRB1*1328
HLA DRB1*1329
HLA DRB1*1330
HLA DRB1*1331
HLA DRB1*1332
HLA DRB1*1333
HLA DRB1*1334
HLA DRB1*1335
HLA DRB1*1336
HLA DRB1*1337
HLA DRB1*1338
HLA DRB1*1339
HLA DRB1*1340
HLA DRB1*1341
HLA DRB1*1342
HLA DRB1*1343
HLA DRB1*1344
HLA DRB1*1345
HLA DRB1*1346
HLA DRB1*1347
HLA DRB1*1348
HLA DRB1*1349
HLA DRB1*1350
HLA DRB1*1351
HLA DRB1*1352
HLA DRB1*1353
HLA DRB1*1354
HLA DRB1*1355
HLA DRB1*1356
HLA DRB1*1357
HLA DRB1*1358
HLA DRB1*1359
HLA DRB1*1360
HLA DRB1*1361
HLA DRB1*1362
HLA DRB1*1363
HLA DRB1*1364
HLA DRB1*1365
HLA DRB1*1366
HLA DRB1*1367
HLA DRB1*1368
HLA DRB1*1369
HLA DRB1*1370
HLA DRB1*1371
HLA DRB1*1372
HLA DRB1*1373
HLA DRB1*1374
HLA DRB1*1375
HLA DRB1*1376
HLA DRB1*1377
HLA DRB1*1378
HLA DRB1*1379
HLA DRB1*1380
HLA DRB1*1381
HLA DRB1*1401
HLA DRB1*1402
HLA DRB1*1403
HLA DRB1*1404
HLA DRB1*1405
HLA DRB1*1406
HLA DRB1*1407
HLA DRB1*1408
HLA DRB1*1409
HLA DRB1*1410
HLA DRB1*1411
HLA DRB1*1412
HLA DRB1*1413
HLA DRB1*1414
HLA DRB1*1415
HLA DRB1*1416
HLA DRB1*1417
HLA DRB1*1418
HLA DRB1*1419
HLA DRB1*1420
HLA DRB1*1421
HLA DRB1*1422
HLA DRB1*1423
HLA DRB1*1424
HLA DRB1*1425
HLA DRB1*1426
HLA DRB1*1427
HLA DRB1*1428
HLA DRB1*1429
HLA DRB1*1430
HLA DRB1*1431
HLA DRB1*1432
HLA DRB1*1433
HLA DRB1*1434
HLA DRB1*1435
HLA DRB1*1436
HLA DRB1*1437
HLA DRB1*1438
HLA DRB1*1439
HLA DRB1*1440
HLA DRB1*1441
HLA DRB1*1442
HLA DRB1*1443
HLA DRB1*1444
HLA DRB1*1445
HLA DRB1*1446
HLA DRB1*1447
HLA DRB1*1448
HLA DRB1*1449
HLA DRB1*1450
HLA DRB1*1451
HLA DRB1*1452
HLA DRB1*1453
HLA DRB1*1454
HLA DRB1*1455
HLA DRB1*1456
HLA DRB1*1457
HLA DRB1*1458
HLA DRB1*1459
HLA DRB1*1460
HLA DRB1*1461
HLA DRB1*1462
HLA DRB1*1463
HLA DRB1*1464
HLA DRB1*1465
HLA DRB1*1467
HLA DRB1*1468
HLA DRB1*1469
HLA DRB1*1470
HLA DRB1*1471
HLA DRB1*1472
HLA DRB1*1473
HLA DRB1*1474
HLA DRB1*1501
HLA DRB1*1502
HLA DRB1*1503
HLA DRB1*1504
HLA DRB1*1505
HLA DRB1*1506
HLA DRB1*1507
HLA DRB1*1508
HLA DRB1*1509
HLA DRB1*1510
HLA DRB1*1511
HLA DRB1*1512
HLA DRB1*1513
HLA DRB1*1514
HLA DRB1*1515
HLA DRB1*1516
HLA DRB1*1518
HLA DRB1*1519
HLA DRB1*1520
HLA DRB1*1521
HLA DRB1*1522
HLA DRB1*1523
HLA DRB1*1524
HLA DRB1*1525
HLA DRB1*1526
HLA DRB1*1527
HLA DRB1*1601
HLA DRB1*1602
HLA DRB1*1603
HLA DRB1*1604
HLA DRB1*1605
HLA DRB1*1607
HLA DRB1*1608
HLA DRB1*1609
HLA DRB1*1610
HLA DRB1*1611
HLA DRB1*1612
HLA DRB3*0101
HLA DRB3*0102
HLA DRB3*0103
HLA DRB3*0104
HLA DRB3*0105
HLA DRB3*0106
HLA DRB3*0107
HLA DRB3*0108
HLA DRB3*0109
HLA DRB3*0110
HLA DRB3*0111
HLA DRB3*0201
HLA DRB3*0202
HLA DRB3*0203
HLA DRB3*0204
HLA DRB3*0205
HLA DRB3*0206
HLA DRB3*0207
HLA DRB3*0208
HLA DRB3*0209
HLA DRB3*0210
HLA DRB3*0211
HLA DRB3*0212
HLA DRB3*0213
HLA DRB3*0214
HLA DRB3*0215
HLA DRB3*0216
HLA DRB3*0217
HLA DRB3*0218
HLA DRB3*0219
HLA DRB3*0220
HLA DRB3*0221
HLA DRB3*0222
HLA DRB3*0223
HLA DRB3*0301
HLA DRB3*0302
HLA DRB3*0303
HLA DRB4*0101
HLA DRB4*0102
HLA DRB4*0103
HLA DRB4*0104
HLA DRB4*0105
HLA DRB4*0106
HLA DRB4*0107
HLA DRB5*0101
HLA DRB5*0102
HLA DRB5*0103
HLA DRB5*0104
HLA DRB5*0105
HLA DRB5*0106
HLA DRB5*0107
HLA DRB5*0108
HLA DRB5*0109
HLA DRB5*0111
HLA DRB5*0112
HLA DRB5*0113
HLA DRB5*0202
HLA DRB5*0203
HLA DRB5*0204
HLA DRB5*0205
H2-IAb
H2-IAd
H2-IEd
Specify Output
Sort peptides by
Position in sequence
MHC prediction score
Output format
XHTML table
Text file